納他霉素是一種天然、廣譜、高效安全的酵母菌及霉菌等絲狀真菌抑制劑，它不僅能夠抑制真菌，還能防止真菌毒素的產生。納他霉素對人體無害，很難被人體消化道吸收，而且微生物很難對其產生抗性，同時因為其溶解度很低等特點，通常用于食品的表面防腐。生物防腐劑。
乳酪
納他霉素可防止乳酪在成熟時發霉，以限制霉菌毒素的形成。因它很難透入乳酪，只停留在乳酪表面，所以在控制乳酪表面霉菌生長很有優勢，而且不影響乳酪的成熟過程。具體的應用方法有三種：1). 0.05%～0.28%納他霉素噴于乳酪制品的表面2). 把鹽漬后的乳酪在0.05%～0.28%濃度懸浮液中浸泡2～4分鐘. 3 把 0.05%納他霉素加到覆蓋乳酪的涂層中。
廣式月餅
月餅營養豐富，餅皮餅餡以及咸蛋黃都常會發生霉變。納他霉素對月餅有良好的防霉效果。 使用時一般采用噴灑法: 將納他霉素產品配制成0.02% ～0.04%的懸浮液，月餅烘烤后冷卻至常溫時，將 Natamycin的懸浮液噴涂在月餅的表面四周及底部，即可完成外部防霉。生咸蛋黃入爐烤至七八成熟，取出冷卻后浸泡于Natamycin懸浮液中約2 分鐘，即可防止蛋黃餡的霉變。
面包糕點
將100~500ppm納他霉素溶液噴在烘焙食品如蛋糕、白面包、酥餅的表面，或將納他霉素噴灑在未烘烤的生面團的表面，其防霉保鮮效果是非常理想，對產品的口感不產生任何影響。
肉制品
采用浸泡或噴灑肉類食品的方法，使用4mg/cm2 納他霉素時即可達到安全而又有效的防霉目的。以0.05%~ 0.2% (w/v)濃度的納他霉素懸浮液浸泡腸衣，或用來浸泡或噴灑已經填好餡料的香腸表面，都可有效地防止香腸表面長霉。烤肉、烤鴨等烤制品、魚干制品，亦可通過噴灑 0.05%~0.1% (w/v) 濃度納他霉素懸浮液，延長產品的貨架期。
沙拉醬
沙拉醬是一種高脂肪食品，每年入夏以后品常有霉變發生。文獻報道沙拉醬中加入10ppm納他霉素，試驗期間未發現變質現象，微生物數量無顯著變化。沙拉醬與乳酪相似，脂肪含量較高，試驗說明納他霉素對高脂肪食品抑菌效果確切。
醬油
在室溫較高的夏季，在醬油中添加 15ppm的納他霉素，可有效抑制酵母菌的生長與繁殖，防止白花的出現。將納他霉素和乳酸鏈球菌素結合起來應用于醬油防霉，可以更有效的抑菌，并降低抑菌濃度。
飲料
由于各種果汁中含糖量、有機酸的含量均較高，很適合酵母菌的生長繁殖，引起果汁的腐敗變質。使用納他霉素可以增加非酒精飲料的貯存穩定性。葡萄汁 應用20ppm的納他霉素即可防止因酵母的污染而導致的果汁發酵，添加100 ppm可完全終止發酵活性。橙汁 由于在自然條件下受到真菌的污染，橙汁一般放置一周便會變壞，加入納他霉素后，即使其劑量低至1.25ppm，存放在2℃～4℃下，保質期可長達8周。納他霉素的抑菌效果與存放溫度有一定的關系，10℃存放的濃縮橙汁，10ppm即可抑制其中的酵母生長；存放在室溫下，則需 20ppm納他霉素才有抑菌作用。 蘋果汁 30ppm的納他霉素，其防止蘋果汁發酵的時間可長達6周之久，且果汁的原有風味絕無改變。番茄汁70 mg/kg濃度的 納他霉素對番茄汁有很好的防霉保鮮效果。
其他
在年糕和饅頭中的使用，可防止霉變，有效地延長貨架期。在食醋等調味品中，使用的納他霉素，可防止霉菌和酵母菌引起的變質。在啤酒、葡萄酒中，2.5mg/kg的納他霉素可使保質期大大延長。此外,在酸奶中添加5～10ppm的納他霉素，可以使產品的貨架期延長4周以上。
